应用化学专业是东莞理工学院2002年3月经教育部批准升格为本科全日制普通高等院校首批本科专业之一，于2002年9月开始招生，并于2006年通过教育部的专业评估。2007年被评为校级名牌专业和重点学科，2008年应用化学专业的一级学科―化学工程与技术已被学校列为学校五个硕士点重点建设学科之一，并于2012年被评为广东省特色重点学科。2011年，应用化学（化学工程与工艺卓越计划班）专业被列为东莞理工学院实施教育部“卓越工程师培养计划”的专业之一。2012年立项为省级特色建设专业，2015年立项为省级应用型示范建设专业。2016年成为学校7个本科一本招生专业之一。下设应用化学、食品质量检测（15、16级）、化工工艺（15级）及卓越计划等专业方向，在校生共628名，其中18级招生116人。
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